I to właśnie w żołądku pokarm pozostaje nieco dłużej – tu jest mieszany z sokiem żołądkowym, rozpoczyna się trawienie, dzięki ruchom żołądka pokarm jest mieszany, bardziej rozdrabniany, zaś kwas solny zabija większość drobnoustrojów, które dostały się tutaj przy okazji.
Następnie porcjami płynna zawiesina przechodzi do dwunastnicy, która jest pierwszym odcinkiem jelita cienkiego. To tutaj dostarczane są enzymy trzustki oraz żółć z wątroby, które umożliwiają chemiczny rozkład tego, co spożywamy, na składniki gotowe do wchłonięcia.
Później cała zawartość przechodzi do jelita cienkiego. Ten odcinek, dzięki licznym kosmkom na swojej powierzchni, umożliwia wchłonięcie pokarmu. Całkowita powierzchnia jelita cienkiego to prawie 200m kwadratowych, co odpowiada wielkości boiska. To dzięki temu wchłanianie jest szybkie i wydajne.