Należy pamiętać, że każda prawidłowo działająca czakra aktywizuje także odpowiadające jej sfery życia psychicznego.
Drugim integralnym i specyficznym elementem dla tej metody jest tzw. rytuał inicjacyjny, który wykonuje Mistrz. Po jego przejściu terapeuta może rozpocząć samodzielne wykonywanie zabiegu.
Rytuał inicjacyjny, znany tylko mistrzom i nauczycielom Reiki otwiera przyszłego terapeutę na przepływ Uniwersalnej Energii Życia, która usuwa powstałe w organizmie blokady, otwiera centra energetyczne i niezwykle skutecznie harmonizuje wszystkie ciała subtelne. Inicjacje są jak duchowe klucze, które otwierają poszczególne zamki. To porównanie nie jest przypadkowe. Określony zamek może otworzyć tylko ten, a nie inny klucz.
Nie są to znaki przypadkowe. Oryginalny i wierny tradycji znak rytuału inicjacyjnego uruchamia daną czakrę. Dlatego tak ważna jest wierność tradycji i linia przekazu. Oczywiście zamki można otwierać nie tylko oryginalnym kluczem ale wytrychem. Grozi wtedy zniszczenie zamka, a w przypadku Reiki – rozbicie czakr i dysharmonia ciał subtelnych. Powrót do normalnego funkcjonowania jest potem niezwykle trudny, co nie znaczy, że nie jest możliwy.